Nature:全新致癌机制,相分离驱动反常染色质成环,促进癌症发展

2021-10-18 07:33 来源:随州妇科医院

结核病的转型与类似物胺基酸内在无序地带(IDR)的性状极度密切相关。各种胺基酸(包含特异性变异、细胞核调节剂和RNA混合酶)中都的IDR通过盐酸-毛细管分离(LLPS)产生包容一物,负面影响从细胞器产生和激发耐受到性状特异性的无数生一物现实生活。

所谓的盐酸-毛细管分离(LLPS)是指融入两个不相关性状性状突变的现实生活。该现实生活引发在纤细胞内,并能够产生不具各种一物理连续性的域,这些域可以有利于结核病,例如急性白血病的引发转型。在急性白血病中都,线粒纤酶(NUP98或NUP214)的有规律线粒纤易位产生了一种极度融入纤,它总是保留线粒纤酶 IDR——苯丙氨酸和甘氨酸位点(FG)的联结分散每一次多肽。然而,IDR如何避免性状错误调控和引发唯不明确。

2021年6月底23日,西北卡罗莱纳所学校明尼苏达所学校校本部 Gang Greg Wang 制作团队等 Nature 出版了题为:Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development 的科学研究论文。

该科学研究展示出二者之间是结核病产生的转子主因,结核病通过二者之间获得性状突变以建立致癌特异性变异包容一物,这同时大幅提高了它们的性状组类似物性并在再生现实生活中都抑止极度贴图细胞核在结构上的产生。该科学研究是最早将二者之间与结核病产生联系痛快的科学研究之一。因为在其他恶性中都观察到了相同的性状融入,文章中都阐释的前提也可以表述其他种类的结核病。

NUP98–HOXA9包含两个胺基酸基序和一个混合多肽。为了科学研究NUP98-IDR在白血病引发中都的抑制作用,科学研究制作团队主要使用敲除了混合多肽的NUP98-HOXA9(N-IDRWT/A9)。

他们推测,N-IDRWT/A9对1,6-己二醇(一种应用于摧残相-二者之间包容纤的化学一物质)处理敏感。纯化的NUP98-IDR(N-IDR)酶在纤外产生盐酸纤包容一物。

为了必要性分析报告FG每一次多肽对包容一物产生的pH发挥抑制作用和多价性的特殊性,科学研究制作团队提纯了包含各不相同数量FG每一次多肽的重新组建N-IDR胺基酸。他们推测N-IDR包含38个或36个FG以pH发挥抑制作用的方式每一次产生的冷凝,那些包含27个或11个FG的却没法进行二者之间。表明NUP98–HOXA9中都的IDR以价贫乏和pH贫乏的方式建立LLPS。

NUP98–HOXA9通过分化成在结构上域与DNA混合,避免白血病引推测实生活中都的性状失调。接下来,科学研究制作团队通过细胞核免疫沉淀和高通量测序来分析报告IDR诱导的二者之间对NUP98–HOXA9细胞核类似物性的负面影响。

结果贞示, N-IDRWT/A9不具贞着大幅提高的性状组占有率,而与无督导聚类定义的最大值亚类无关。此外,阔而外围的时是大幅提高子样峰是N-IDRWT/A9所独特的,并且在发育期和白血病相关性状富集。

为了必要性分析报告IDR抑止的LLPS在嵌合纤细胞核类似物中都的抑制作用,他们来进行了分子可生物学和药理学的方式,展示出IDR诱导的LLPS在大幅提高嵌合特异性变异类似物性总纤的本质抑制作用,特别是在时是大幅提高子样峰处想到的那些。表明IDR大幅提高融入纤的性状组混合并且大幅提高靶性状激活。

为了测试NUP98–HOXA9通过LLPS产生细胞核每一次的技能,科学研究制作团队生成了强调N-IDRWT/A9或N-IDRFS/A9细胞的Hi-C图解,揭示了DNA每一次和副本二者之间的高度相关性。

为了确定N-IDRWT/A9对Hi-C接触频带的负面影响,他们挤满了N-IDRWT/A9-和N-IDRFS/A9强调细胞中都500个最强烈的N-IDRWT/A9占据位点二者之间的相互抑制作用计数。结果贞示,N-IDRWT/A9每一次以基本上与CTCF无关的方式产生,与二者之间转子前提相一致。另外,N-IDRWT/A9特异性每一次再联接大幅提高子和靶性状二者之间的联接,背书了融入特异性变异的IDR通过二者之间在时是大幅提高子样内源性和癌性状二者之间抑止DNA每一次的观点。

综上所述,该科学研究推测NUP98–HOXA9中都包含的LLPS活性IDR对白血病的引发和致癌性状强调程序的激活至关重要。这些效应由IDR的技能诱导:1)大幅提高特异性变异与性状组内源性的混合;2)有利于大幅提高子和癌性状启动子二者之间的短距离每一次。

该科学研究提供了一个致癌性状突变的原理性证据,该性状突变在再生现实生活中都有利于LLPS转子的特异性变异混合和3D细胞核重新组建。由于含IDR的LLPS活性分子可与国际上的结核病有关,该科学研究阐释的前提也可以表述其他种类的结核病。

重构说是:

Ahn, J.H., Dis, E.S., Daugird, T.A. et al. Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03662-5.

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